全转录组测序构建HPH大鼠ceRNA调控网络
全转录组测序结果初步分析 对来自HPH大鼠和对照大鼠肺部的6个样品进行全转录组测序。
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA。
全转录组不是全长转录组,全转录组说的是检测普通mRNA,加上 lncRNA,miRNA,CircRNA这样的3种常规 非编码基因,而全长转录组说的是测序的时候采取三代测序等技术这样可以把基因的转录产物的全部长度的碱基一次性测序到,这样很方便知道不同可变剪切转录本的区别。
下面我们先看下这篇文章具体内容: 实验简介: 文章研究的是小麦幼苗在麦二叉蚜采食后的快速防卫反应,分别于采食1248 h后取幼苗叶片(3次生物学重复),进行转录组测序、叶绿素测定以及H2O2 积累测定以及NADPH抑制剂处理进一步探究小麦在咬食后氧迸发防御机制。
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